Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm3298E9PW80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm3298E9PW80 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
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