Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FgaE9PV24 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FgaE9PV24 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms