Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3bE9PUL3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms