Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptrhd1D3Z4S3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptrhd1D3Z4S3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms