Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
9630041A04RikD3Z3U4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
9630041A04RikD3Z3U4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms