Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6685D3YYP3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms