Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kif28pD3YXS5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms