Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc170D3YXL0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms