Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SafbD3YXK2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SafbD3YXK2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms