Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam47eD3YWC7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms