Protein–RNA interactions for Protein: D3YUG0

Samd13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd13D3YUG0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Samd13D3YUG0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms