Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cspp1B2RX88 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms