Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah3B2RWG3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms