Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb8B1AY40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb8B1AY40 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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