Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms