Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc23lA6H6E9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc23lA6H6E9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ttc23lA6H6E9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ttc23lA6H6E9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc23lA6H6E9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms