Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttll2A4Q9E4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms