Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn3aA2ASI5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms