Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itga8A2ARA8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga8A2ARA8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms