Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp1bA1Z198 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms