Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc173A0JLY1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc173A0JLY1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms