Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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