Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms