Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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