Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms