Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B020011L13RikA0A087WQI7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B020011L13RikA0A087WQI7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms