Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2210011C24RikA0A087WQ89 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms