Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
EHD3Q9NZN3 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms