Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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