Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEH1LQ96EE3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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