Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
UBXN4Q92575 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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