Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms