Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TMEM200BQ69YZ2 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TMEM200BQ69YZ2 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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