Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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