Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FXNQ16595 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FXNQ16595 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FXNQ16595 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FXNQ16595 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FXNQ16595 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
FXNQ16595 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FXNQ16595 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FXNQ16595 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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