Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SLC18A3Q16572 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SLC18A3Q16572 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms