Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RPE65Q16518 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPE65Q16518 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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