Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms