Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SCN9AQ15858 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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SCN9AQ15858 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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SCN9AQ15858 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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