Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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