Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
TAF11Q15544 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF11Q15544 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms