Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GPNMBQ14956 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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GPNMBQ14956 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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GPNMBQ14956 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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GPNMBQ14956 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
GPNMBQ14956 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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