Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CAPRIN1Q14444 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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