Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
COL4A6Q14031 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
COL4A6Q14031 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms