Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALCAMQ13740 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ALCAMQ13740 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ALCAMQ13740 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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