Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL4AQ13619 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL4AQ13619 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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