Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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CUL1Q13616 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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CUL1Q13616 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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CUL1Q13616 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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CUL1Q13616 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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