Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HDAC1Q13547 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HDAC1Q13547 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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