Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SKP2Q13309 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SKP2Q13309 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SKP2Q13309 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SKP2Q13309 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SKP2Q13309 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SKP2Q13309 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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SKP2Q13309 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
SKP2Q13309 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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