Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SRSF5Q13243 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms